《植物生理学报》 2008, 44(6): 1099-1105

盐胁迫下西伯利亚蓼6 个时期混合叶cDNA 文库的构建和初步分析

刘关君*, 刘明坤, 许志茹, 阎秀峰, 朱翔, 杨传平

东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室, 哈尔滨150040

通信作者：刘关君；E-mail: liuguanjun2003@126.com；Tel: 0451-82190607

摘　要：

以 3% NaHCO3 胁迫处理西伯利亚蓼 2 h、6 h、12 h、1 d、2 d 和 3 d 共 6 个时期混合叶为材料, 提取总 RNA。根据 Stratagene 公司 cDNA 建库试剂盒构建了西伯利亚蓼混合叶 cDNA 文库。原始文库滴度为 2.0×106 pfu•mL-1, 扩增后文库滴 度为4.5×109 pfu•mL-1, 重组率为95.9%, 插入片段大小在0.3~1.5 kb 之间, 平均长度为0.45 kb 左右。经测序获得2 575 个EST 序列, 拼接出 1 977 个假定独立转录本(TUTs), 其中文库中含有大量低丰度表达基因, 约占 TUTs 总数的 89.58%。BlastX 分 析表明, 1 977 个 TUTs 中共有 720 个 TUTs 有明确功能注释, 其中参与胁迫过程中代谢、能量、光合作用和蛋白合成基因 表达量较高, 而涉及转录、信号转导、细胞防御和救援基因表达量较低。

关键词：西伯利亚蓼; 混合叶; cDNA文库

收稿：2008-07-07   修定：2008-11-03

资助：黑龙江省科技攻关重点项目(GB06B303)。

盐胁迫下西伯利亚蓼6 个时期混合叶cDNA 文库的构建和初步分析

刘关君*, 刘明坤, 许志茹, 阎秀峰, 朱翔, 杨传平

东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室, 哈尔滨150040

Corresponding author: ; E-mail: liuguanjun2003@126.com; Tel: 0451-82190607

Abstract:

以 3% NaHCO3 胁迫处理西伯利亚蓼 2 h、6 h、12 h、1 d、2 d 和 3 d 共 6 个时期混合叶为材料, 提取总 RNA。根据 Stratagene 公司 cDNA 建库试剂盒构建了西伯利亚蓼混合叶 cDNA 文库。原始文库滴度为 2.0×106 pfu•mL-1, 扩增后文库滴 度为4.5×109 pfu•mL-1, 重组率为95.9%, 插入片段大小在0.3~1.5 kb 之间, 平均长度为0.45 kb 左右。经测序获得2 575 个EST 序列, 拼接出 1 977 个假定独立转录本(TUTs), 其中文库中含有大量低丰度表达基因, 约占 TUTs 总数的 89.58%。BlastX 分 析表明, 1 977 个 TUTs 中共有 720 个 TUTs 有明确功能注释, 其中参与胁迫过程中代谢、能量、光合作用和蛋白合成基因 表达量较高, 而涉及转录、信号转导、细胞防御和救援基因表达量较低。

Key words: 西伯利亚蓼; 混合叶; cDNA文库